Mandag den 24. juni 2013.-Forskere fra Australien og USA giver ny viden til forståelsen af genomets tredimensionelle struktur, en af de største udfordringer i øjeblikket inden for genomik og genetik, hvis konklusioner det offentliggør i sin digitale udgave ' Naturgenetik '.
Cirka tre meter DNA er tæt foldet i kernen i hver celle i vores krop, hvilket gør det muligt for nogle gener at "udtrykke" eller aktivere, eksklusive andre. Lægerne Tim Mercer og John Mattick fra Garvan Institute for Medical Research i Sydney og professor John Stamatoyannopoulos fra University of Washington i Seattle analyserede genomets 3D-struktur med høj opløsning.
Generene er sammensat af "eksoner" og "introner", hvor de første er sekvenserne, der koder og udtrykker proteinerne, og de sidste strækninger af ikke-kodende DNA i mediet. Når gener kopieres eller transkriberes, fra DNA i RNA, skæres eller "splejses" intronsekvenser, og de resterende exoner kædes sammen for at danne en sekvens, der koder for et protein. Afhængigt af de eksoner, der er spredte, kan det samme gen generere forskellige proteiner.
Gennem brugen af store mængder data fra ENCODE-projektet har Dr. Tim Mercer og hans kolleger fundet foldningen af genomet og konstateret, at selv i et gen kan de udvalgte eksoner let udsættes. "Forestil dig en lang og uhyre kompliceret vinstok, dens snoede grene, der præsenterer nogle druer, der let kan rives af, mens du skjuler andre uden for deres rækkevidde, " giver han et eksempel. Mercer.
"Forestil dig samtidig en doven frugtplukker, der bare pluk druerne ved hånden - tilføjer han -. Det samme princip gælder for genomet. Specifikke gener og endda specifikke eksoner er inden for rækkevidde af foldning." I denne forstand påpeger denne forsker, at forskere i de senere år er begyndt at værdsætte, hvordan genomfoldning hjælper med at bestemme, hvordan det udtrykkes og reguleres.
"Denne undersøgelse giver den første indikation af, at genomets tredimensionelle struktur kan påvirke splejsningen af gener. Vi kan udlede, at genomet foldes på en sådan måde, at promotorregionen, den sekvens, der initierer transkription af et gen, er fundet ved siden af eksonerne, og de føres alle til transkriptionsmaskineriet, ”understreger han.
"Dette understøtter en ny måde at se tingene på, som genomet bøjer sig rundt om transkriptionsmaskineriet snarere end omvendt. De gener, der kommer i kontakt med transkriptionsmaskineriet, får kopier, mens de dele, der kredser langt væk de ignoreres, ”konkluderer denne forsker.
Kilde:
Tags:
Ernæring Forskellige Nyheder
Cirka tre meter DNA er tæt foldet i kernen i hver celle i vores krop, hvilket gør det muligt for nogle gener at "udtrykke" eller aktivere, eksklusive andre. Lægerne Tim Mercer og John Mattick fra Garvan Institute for Medical Research i Sydney og professor John Stamatoyannopoulos fra University of Washington i Seattle analyserede genomets 3D-struktur med høj opløsning.
Generene er sammensat af "eksoner" og "introner", hvor de første er sekvenserne, der koder og udtrykker proteinerne, og de sidste strækninger af ikke-kodende DNA i mediet. Når gener kopieres eller transkriberes, fra DNA i RNA, skæres eller "splejses" intronsekvenser, og de resterende exoner kædes sammen for at danne en sekvens, der koder for et protein. Afhængigt af de eksoner, der er spredte, kan det samme gen generere forskellige proteiner.
Gennem brugen af store mængder data fra ENCODE-projektet har Dr. Tim Mercer og hans kolleger fundet foldningen af genomet og konstateret, at selv i et gen kan de udvalgte eksoner let udsættes. "Forestil dig en lang og uhyre kompliceret vinstok, dens snoede grene, der præsenterer nogle druer, der let kan rives af, mens du skjuler andre uden for deres rækkevidde, " giver han et eksempel. Mercer.
"Forestil dig samtidig en doven frugtplukker, der bare pluk druerne ved hånden - tilføjer han -. Det samme princip gælder for genomet. Specifikke gener og endda specifikke eksoner er inden for rækkevidde af foldning." I denne forstand påpeger denne forsker, at forskere i de senere år er begyndt at værdsætte, hvordan genomfoldning hjælper med at bestemme, hvordan det udtrykkes og reguleres.
"Denne undersøgelse giver den første indikation af, at genomets tredimensionelle struktur kan påvirke splejsningen af gener. Vi kan udlede, at genomet foldes på en sådan måde, at promotorregionen, den sekvens, der initierer transkription af et gen, er fundet ved siden af eksonerne, og de føres alle til transkriptionsmaskineriet, ”understreger han.
"Dette understøtter en ny måde at se tingene på, som genomet bøjer sig rundt om transkriptionsmaskineriet snarere end omvendt. De gener, der kommer i kontakt med transkriptionsmaskineriet, får kopier, mens de dele, der kredser langt væk de ignoreres, ”konkluderer denne forsker.
Kilde:
